More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12220 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  100 
 
 
130 aa  270  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  65.32 
 
 
128 aa  187  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  61.47 
 
 
117 aa  155  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  63.81 
 
 
114 aa  153  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
113 aa  108  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  43.64 
 
 
114 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.85 
 
 
367 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  47.17 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  43.64 
 
 
114 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  44.14 
 
 
114 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 
119 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
119 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  45.13 
 
 
116 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
119 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
123 aa  103  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
112 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
114 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  45.69 
 
 
119 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 
116 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 
114 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  39.82 
 
 
121 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
114 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  42.73 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  42.73 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  39.68 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  45.69 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
114 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.52 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  45.54 
 
 
114 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
113 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  40.71 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  42.74 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
114 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  44.34 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  40.54 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  41.88 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  38.6 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  40.17 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
114 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  41.88 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  41.74 
 
 
118 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  40.91 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  40.18 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 
114 aa  94  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  39.83 
 
 
113 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.67 
 
 
115 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
117 aa  94  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  41.44 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
114 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  41.23 
 
 
124 aa  93.2  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>