More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1852 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
114 aa  238  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  66.96 
 
 
113 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  65.79 
 
 
114 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  61.06 
 
 
123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  60.71 
 
 
113 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  60.53 
 
 
114 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  59.65 
 
 
114 aa  158  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  60.53 
 
 
114 aa  155  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  60.53 
 
 
114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
114 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  60.71 
 
 
112 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
114 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  56.64 
 
 
121 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
113 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 
114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
114 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
121 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
114 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  59.82 
 
 
112 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  59.82 
 
 
112 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
114 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  58.93 
 
 
112 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
114 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
114 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  53.57 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  53.57 
 
 
113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  58.93 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
113 aa  143  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  58.93 
 
 
112 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
126 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
112 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
112 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
112 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  50.44 
 
 
116 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  53.51 
 
 
113 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  53.51 
 
 
113 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
116 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  140  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  58.33 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  54.39 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
113 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  49.11 
 
 
115 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 
114 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
114 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
126 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
115 aa  135  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 
114 aa  135  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
113 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  56.14 
 
 
114 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
113 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
113 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
114 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  58.04 
 
 
114 aa  134  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  53.27 
 
 
116 aa  134  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
122 aa  133  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  53.21 
 
 
114 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 
114 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  51.33 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
115 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  55.45 
 
 
135 aa  129  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  56.64 
 
 
117 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  50.45 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.64 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
116 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
112 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
117 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  50.47 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
116 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  53.27 
 
 
116 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  53.27 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  53.27 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  53.27 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  53.27 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  54.63 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  48.6 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  52.68 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  44.64 
 
 
367 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
114 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
118 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  49.53 
 
 
116 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 
113 aa  124  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  50.47 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>