More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0705 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 119 aa  246  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  89.08 
 
 		 119 aa  224  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  77.31 
 
 		 119 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  77.78 
 
 		 118 aa  201  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  76.47 
 
 		 119 aa  200  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  76.27 
 
 		 120 aa  197  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  73.11 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  76.07 
 
 		 132 aa  193  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  71.93 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  62.71 
 
 		 118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  64.41 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  63.03 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  63.03 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  64.91 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  68.52 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  59.32 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  59.17 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 115 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  58.33 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  57.5 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  55.83 
 
 		 124 aa  137  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  55.83 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  55.83 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  55.83 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  55 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  58.56 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  55.66 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  54.72 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  53.77 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  53.27 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  52.34 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  50.86 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  45.79 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  45.79 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  48.51 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  47.52 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 116 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  48.11 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  49 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  47.71 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  43.52 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.69 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.55 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  45.87 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  45.13 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  44.95 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  44.04 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  44.04 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.11 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.36 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>