More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1971 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  55.14 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  50.96 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  51.96 
 
 		 113 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  53.92 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 135 aa  113  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  50.5 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  48.51 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  50.5 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00781  HIT (histidine triad) family protein  48.04 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00791  HIT (histidine triad) family protein  49.02 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  51.92 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  48.04 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  44.66 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0069  HIT (histidine triad) family protein  47.06 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  51.46 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  46.53 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  46.53 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  49.51 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  46.6 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  50.5 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  42.57 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  53.92 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0691  histidine triad (HIT) protein  48 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  49.5 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  42.72 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  49.5 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  49.5 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  45.1 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  40.78 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  47.12 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  47.57 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  44.23 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  45.19 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 		 113 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  44.76 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  44.76 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  43.81 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 		 170 aa  97.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  44.23 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  43.27 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  46.08 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  46.15 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  42.16 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.06 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  46.23 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  42.31 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  42.72 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  44.12 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  44.12 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  45.19 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.27 
 
 		 367 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 120 aa  93.6  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>