More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03447 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  100 
 
 
123 aa  256  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  81.51 
 
 
121 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  76.67 
 
 
121 aa  204  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  61.06 
 
 
114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  60.18 
 
 
114 aa  154  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  63.06 
 
 
112 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
113 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  64.81 
 
 
116 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  62.16 
 
 
112 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
126 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  59.29 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  63.06 
 
 
112 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  61.06 
 
 
113 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  61.06 
 
 
113 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
112 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  60.19 
 
 
116 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
112 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 
135 aa  148  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  61.11 
 
 
116 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
112 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  61.11 
 
 
116 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  58.56 
 
 
112 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  60.19 
 
 
117 aa  146  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  58.33 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  59.26 
 
 
116 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  56.36 
 
 
113 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
114 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  54.87 
 
 
114 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  57.41 
 
 
118 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  57.41 
 
 
118 aa  140  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
117 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  58.33 
 
 
116 aa  140  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  50 
 
 
121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  55.56 
 
 
118 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 
118 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 
118 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 
118 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  57.27 
 
 
114 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  56.64 
 
 
113 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  53.7 
 
 
116 aa  136  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
126 aa  136  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
116 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  58.72 
 
 
117 aa  135  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  58.72 
 
 
117 aa  135  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  55.56 
 
 
117 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  54.87 
 
 
114 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  55.56 
 
 
116 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
122 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  54.63 
 
 
118 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 
114 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  50 
 
 
116 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  54.95 
 
 
114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  55.56 
 
 
116 aa  134  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  53.7 
 
 
116 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  53.7 
 
 
117 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  53.7 
 
 
117 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  53.7 
 
 
117 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1618  purine nucleoside phosphoramidase  59.26 
 
 
119 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104528  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  54.87 
 
 
114 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
116 aa  133  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
114 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
114 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  58.33 
 
 
119 aa  133  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  57.01 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  52.25 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  53.7 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  51.35 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  57.41 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  57.41 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  57.41 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  57.41 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  57.41 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  51.82 
 
 
113 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 
114 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  51.82 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  49.55 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  51.35 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>