More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2973 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
135 aa  276  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  67.26 
 
 
114 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  63.64 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 
116 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  54.62 
 
 
126 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  60 
 
 
123 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  63.64 
 
 
122 aa  147  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  60.91 
 
 
121 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  60.91 
 
 
113 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  60.91 
 
 
113 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
126 aa  146  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  58.18 
 
 
112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  58.18 
 
 
112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  58.72 
 
 
112 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  59.46 
 
 
114 aa  144  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  60.91 
 
 
113 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00781  HIT (histidine triad) family protein  59.82 
 
 
113 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00791  HIT (histidine triad) family protein  60.71 
 
 
113 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0069  HIT (histidine triad) family protein  58.93 
 
 
113 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
115 aa  140  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  58.18 
 
 
121 aa  140  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  62.73 
 
 
113 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  60 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 
113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  61.82 
 
 
113 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  58.04 
 
 
113 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  55.45 
 
 
111 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  55.45 
 
 
111 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  55.45 
 
 
114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  55.45 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  55.36 
 
 
113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 
114 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  55.45 
 
 
114 aa  129  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33695  predicted protein  54.24 
 
 
138 aa  129  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  54.13 
 
 
112 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  52.73 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
113 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
113 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  52.73 
 
 
114 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  52.29 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  52.29 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  52.73 
 
 
116 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  53.7 
 
 
116 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
113 aa  123  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16130  predicted protein  54.46 
 
 
137 aa  123  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.145557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
114 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
114 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 
113 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  51.89 
 
 
121 aa  122  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  52.73 
 
 
113 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  52.73 
 
 
113 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  50.91 
 
 
113 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  52.78 
 
 
116 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  50.93 
 
 
116 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
113 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  51.85 
 
 
116 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  50.91 
 
 
113 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14064  predicted protein  50 
 
 
177 aa  120  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  56.36 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.15 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 
116 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  55.66 
 
 
114 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
114 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
112 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
112 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
118 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
118 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
118 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
118 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  52.78 
 
 
116 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
118 aa  116  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  48.15 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  50.48 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  50 
 
 
116 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 
117 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 
117 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 
117 aa  114  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  49.07 
 
 
117 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  50.93 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>