More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3057 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 115 aa  230  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  58.18 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  57.14 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  54.81 
 
 		 115 aa  130  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 118 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  50.48 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  55.24 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  51.89 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  45.37 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  44.44 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.85 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  47.17 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 116 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  44.14 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  48.11 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  47.17 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 113 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  53.92 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  44.86 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  44.86 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.18 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  45.45 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  45.79 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  42.73 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  47.17 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  43.64 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  48.08 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.44 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  45.36 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>