More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0461 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 112 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  89.29 
 
 		 112 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  87.5 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  88.39 
 
 		 112 aa  206  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  87.5 
 
 		 112 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  76.79 
 
 		 112 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  75 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  74.11 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  62.16 
 
 		 113 aa  153  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  61.95 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  61.26 
 
 		 113 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  61.26 
 
 		 113 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  60.36 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 		 114 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  58.56 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  57.66 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  58.41 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  58.72 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  59.46 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  58.93 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  56.76 
 
 		 116 aa  140  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  57.66 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  55.36 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  58.04 
 
 		 114 aa  137  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  56.25 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  54.95 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  58.18 
 
 		 115 aa  133  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  55.36 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  54.46 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  54.55 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  54.55 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  52.34 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  55.24 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  51.4 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  51.4 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  50.45 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 114 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  49.07 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  49.07 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  49.07 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  49.07 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  45.95 
 
 		 113 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  51.92 
 
 		 119 aa  116  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  44.64 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  48.15 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00781  HIT (histidine triad) family protein  50.46 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00791  HIT (histidine triad) family protein  51.38 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  46.73 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  44.64 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  49.07 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  48.54 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  51.46 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0069  HIT (histidine triad) family protein  49.54 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  51.46 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33695  predicted protein  46.85 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  54 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  48.54 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  48.54 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  48.54 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  45.95 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  48.54 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  48.54 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  49.54 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  48.54 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>