More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0560 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
112 aa  225  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  65.77 
 
 
115 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  63.21 
 
 
113 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  63.21 
 
 
113 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  58.49 
 
 
115 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
119 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  56.07 
 
 
123 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 
113 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  59.63 
 
 
116 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  54.21 
 
 
121 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  54.63 
 
 
112 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
114 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  53.7 
 
 
112 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  54.63 
 
 
112 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.06 
 
 
116 aa  120  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  52.78 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  52.34 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  57.94 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
135 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  56.73 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
121 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  56.6 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
114 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  52.29 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 
114 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 
121 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
116 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02440  HIT domain, putative  54.63 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  49.09 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  49.54 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  44.95 
 
 
116 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
113 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  51.4 
 
 
130 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 
126 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
114 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  48.18 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  47.71 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  48.15 
 
 
112 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
115 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
114 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
118 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  45.87 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  45.79 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  46.79 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  45.37 
 
 
113 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  45.37 
 
 
113 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  47.27 
 
 
121 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  48.11 
 
 
114 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
114 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
114 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  46.79 
 
 
116 aa  105  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
114 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
112 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
118 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  46.73 
 
 
117 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
118 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  46.73 
 
 
117 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  46.73 
 
 
117 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  48.11 
 
 
114 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
118 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
118 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
118 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  45.87 
 
 
117 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>