More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3550 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  96.69 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  91.74 
 
 		 124 aa  237  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  90.08 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  90.08 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  90.08 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  90.91 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  90.91 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  89.26 
 
 		 121 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  87.6 
 
 		 121 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  90.08 
 
 		 121 aa  228  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  89.26 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  59.32 
 
 		 115 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 118 aa  146  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  56.78 
 
 		 116 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  54.62 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  57.5 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  54.24 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  55 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  54.24 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  51.67 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  53.04 
 
 		 118 aa  129  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  50 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  54.63 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  53.7 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 113 aa  116  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  52.83 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  49.14 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  49.5 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  51.89 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  51.89 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  46.96 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  46.3 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  46.08 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  45.1 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 113 aa  105  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  46.3 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  47.22 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 		 115 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  41.96 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  47.22 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.61 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  41.96 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  43.09 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  43.4 
 
 		 116 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  45.37 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>