More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0743 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
119 aa  247  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  99.16 
 
 
119 aa  245  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  82.91 
 
 
132 aa  208  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  81.2 
 
 
118 aa  204  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  77.31 
 
 
119 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  76.27 
 
 
120 aa  196  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  73.95 
 
 
119 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  70.59 
 
 
119 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  69.83 
 
 
123 aa  180  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  62.71 
 
 
118 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  61.02 
 
 
116 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  60.17 
 
 
118 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  59.66 
 
 
115 aa  156  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  63.55 
 
 
117 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  57.98 
 
 
118 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  56.67 
 
 
121 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 
118 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  59.46 
 
 
115 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
121 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
121 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
121 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  54.05 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
121 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
121 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
121 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
121 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  52.5 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  51.67 
 
 
124 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  53.27 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  52.34 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  51.4 
 
 
114 aa  124  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  53.77 
 
 
112 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 
114 aa  120  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  53.77 
 
 
112 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
116 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  51.89 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
115 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  47.27 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  44.86 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
114 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
113 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
117 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  44.86 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 
126 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.61 
 
 
112 aa  107  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
114 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  49.06 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
112 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 
114 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
114 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
113 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
113 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
114 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  42.34 
 
 
120 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
113 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.1 
 
 
130 aa  104  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
114 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.92 
 
 
128 aa  104  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
131 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.36 
 
 
124 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  43.48 
 
 
146 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
116 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
116 aa  103  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 
122 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
106 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  42.99 
 
 
367 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
132 aa  102  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
115 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  42.57 
 
 
113 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  42.99 
 
 
114 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  44.55 
 
 
116 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.12 
 
 
114 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.41 
 
 
115 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  43.4 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
113 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
118 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>