More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11720 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  100 
 
 
115 aa  236  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  57.52 
 
 
116 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
115 aa  137  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  55.45 
 
 
114 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  56.76 
 
 
120 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  55.05 
 
 
115 aa  130  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  58.72 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  52.17 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
120 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  54.87 
 
 
116 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  47.71 
 
 
113 aa  123  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  56.64 
 
 
117 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
114 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  53.27 
 
 
113 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  47.71 
 
 
113 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
114 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  52.73 
 
 
120 aa  120  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  50 
 
 
114 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  54.21 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
114 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  50 
 
 
114 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.02 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
113 aa  116  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
114 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  53.7 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.47 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
119 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
114 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.93 
 
 
130 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
116 aa  114  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  50 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.54 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  48.57 
 
 
127 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
114 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  48.62 
 
 
119 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  47.22 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.12 
 
 
367 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.34 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  45.87 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
132 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  45.79 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 
117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
117 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  45.79 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
113 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
114 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
114 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
114 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
118 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  48.57 
 
 
121 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
114 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
115 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  48.57 
 
 
121 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  40.19 
 
 
116 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  43.93 
 
 
116 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
126 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
117 aa  104  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
114 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  47.62 
 
 
121 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 
118 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  43.24 
 
 
116 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 
116 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
119 aa  103  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>