More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1547 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 119 aa  246  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  62.18 
 
 		 119 aa  167  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  63.39 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  50.45 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  53.1 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.79 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.95 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  46.96 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.64 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  47.5 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  46.55 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.64 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3399  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.61 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.16 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  42.74 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  41.94 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  38.46 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  43.75 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  38.05 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  38.05 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  38.39 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  38.39 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  41.32 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  38.98 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  38.18 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  39.83 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  40.54 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  39.82 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  40.21 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  38.89 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  38.89 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  37.84 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  36.36 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  37.61 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16130  predicted protein  35.09 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.145557  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14064  predicted protein  42.24 
 
 		 177 aa  87  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>