More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1575 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
118 aa  242  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  59.13 
 
 
116 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  59.29 
 
 
114 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  57.02 
 
 
115 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  64.6 
 
 
112 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  59.82 
 
 
114 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  56.25 
 
 
113 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  55.36 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  56.25 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  55.65 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  53.39 
 
 
127 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  55.08 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 
128 aa  134  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
114 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  56.52 
 
 
117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 
114 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  57.89 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  54.87 
 
 
114 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
113 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
114 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  52.21 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.68 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  56.41 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
115 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  59.26 
 
 
120 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
113 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  51.33 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.9 
 
 
367 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 
113 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  48.21 
 
 
114 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
114 aa  124  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
114 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.57 
 
 
116 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  50.43 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  54.21 
 
 
130 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
114 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
113 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
113 aa  121  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  46.43 
 
 
114 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
113 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
132 aa  120  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  51.75 
 
 
120 aa  121  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.46 
 
 
112 aa  120  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
114 aa  120  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  46.49 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  49.12 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
117 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  48.6 
 
 
117 aa  117  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  47.32 
 
 
112 aa  116  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
112 aa  116  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 
122 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  47.37 
 
 
113 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  49.07 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
113 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
114 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
113 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.29 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  49.55 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  49.55 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
119 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
121 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  44.74 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  44.55 
 
 
111 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  44.55 
 
 
111 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  110  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.6 
 
 
114 aa  110  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  46.49 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  45.54 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  46.43 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>