More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1655 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 119 aa  238  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  65.25 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  61.34 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  69.23 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  56.78 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  62.39 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  61.02 
 
 		 115 aa  146  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  65.55 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  56.41 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  47.9 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  55.46 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 		 114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  55.46 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  50.42 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  47.06 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  57.98 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  47.9 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  59.65 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  51.26 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  46.22 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  44.54 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  58.41 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  51.26 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  49.57 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  52.1 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  58.41 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  49.57 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  55.26 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  55.17 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  60.71 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.61 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  55.46 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  49.57 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  48.74 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  48.74 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  50.43 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  47.5 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  51.67 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  44.54 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  49.57 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  42.86 
 
 		 367 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  45.69 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  44.92 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  47.01 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  44.92 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  47.9 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  50.43 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  47.41 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.68 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  42.61 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  42.61 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  48.76 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  47.5 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  46.55 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.11 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  48.21 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  47.86 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  50.46 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>