More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1076 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
114 aa  239  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  65.79 
 
 
114 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  60.53 
 
 
114 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 
114 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  60.53 
 
 
114 aa  161  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 
114 aa  156  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  61.26 
 
 
112 aa  154  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  59.65 
 
 
114 aa  153  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  57.89 
 
 
114 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  60.36 
 
 
113 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  59.29 
 
 
123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  57.14 
 
 
113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 
113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  58.77 
 
 
113 aa  150  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  58.77 
 
 
113 aa  150  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  58.41 
 
 
121 aa  150  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  57.14 
 
 
113 aa  150  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
114 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  60.91 
 
 
112 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 
112 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 
112 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 
112 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  51.75 
 
 
114 aa  146  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  54.87 
 
 
121 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
114 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  50.88 
 
 
114 aa  143  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  59.09 
 
 
126 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 
114 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  60 
 
 
112 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 
112 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  54.46 
 
 
115 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  57.94 
 
 
114 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  57.66 
 
 
115 aa  141  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  59.09 
 
 
131 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  53.51 
 
 
114 aa  140  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 
115 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
114 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
112 aa  140  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  53.51 
 
 
114 aa  139  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  55.86 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 
114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 
114 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  54.95 
 
 
112 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
126 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
113 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
113 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  55.36 
 
 
126 aa  136  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  54.72 
 
 
116 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
113 aa  136  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
116 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
113 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
114 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  54.29 
 
 
116 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 
112 aa  134  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  53.77 
 
 
116 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  56.76 
 
 
114 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 
113 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
126 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  53.77 
 
 
116 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  54.95 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.56 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 
116 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
126 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 
128 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  48.21 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  48.21 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  54.55 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  51.89 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  50 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  50.94 
 
 
116 aa  127  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 
119 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
118 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 
116 aa  126  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 
117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.49 
 
 
367 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  50.48 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  53.77 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  53.77 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  53.77 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  51.89 
 
 
117 aa  124  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
118 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
118 aa  123  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
118 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
118 aa  123  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>