More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1062 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  100 
 
 		 115 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  61.61 
 
 		 114 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  52.21 
 
 		 367 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  54.78 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  53.98 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  50.43 
 
 		 114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  57.14 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  49.57 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  56.25 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  53.04 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 		 114 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  51.79 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  58.18 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  58.18 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  58.18 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  51.79 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  51.3 
 
 		 114 aa  131  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  54.78 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  51.75 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  58.18 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  54.95 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  54.95 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  49.09 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  50.43 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  49.07 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  48.18 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  48.18 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  45.76 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  46.43 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  46.36 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  45.45 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 118 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  46.43 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.74 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  46.09 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  44.35 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  49.09 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  46.43 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  49.07 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  44.55 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  46.36 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>