More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1369 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  62.28 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  57.01 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  54.13 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  52.29 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 		 113 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  121  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  46.73 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  46.73 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  48.62 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  47.62 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  45.37 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  47.37 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  46.6 
 
 		 113 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  45.13 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  40.91 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  43.36 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  42.45 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  46.02 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  43.36 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.19 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 116 aa  110  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  45.54 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  47.96 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  44.55 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  44.64 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  46.79 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  46.94 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  47.27 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  41.96 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.22 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  45.05 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  49.04 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  47.27 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  47.96 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>