More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1195 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  78.51 
 
 
121 aa  204  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  78.51 
 
 
121 aa  203  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  77.69 
 
 
121 aa  203  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  67.52 
 
 
117 aa  169  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  63.25 
 
 
119 aa  165  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  70.19 
 
 
118 aa  159  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  61.32 
 
 
118 aa  144  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  58.25 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.79 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 
114 aa  105  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
118 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  44.34 
 
 
114 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
114 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
114 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
118 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
115 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
116 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
115 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
113 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  43.4 
 
 
114 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
118 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  45.63 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 
114 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
126 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  42.59 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  40.37 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.06 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  43.64 
 
 
116 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
113 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  42.59 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  42.99 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
114 aa  95.9  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.9 
 
 
367 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  43.75 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.06 
 
 
130 aa  95.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.61 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
117 aa  94.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.52 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
119 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
119 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 
120 aa  93.6  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  41.82 
 
 
116 aa  93.6  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  41.82 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  41.82 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
135 aa  93.2  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  41.51 
 
 
113 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 
116 aa  92  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  33.9 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  41.82 
 
 
116 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.62 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
116 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  41.82 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  41.82 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  40.91 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  41.82 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  40 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>