More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3592 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  68.38 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  64.41 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  63.48 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  65.22 
 
 		 125 aa  160  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  62.18 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  57.76 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  57.63 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  47.01 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  48.21 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  52.68 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  47.66 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  43.93 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  44.63 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  47.17 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  45.79 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  49.55 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  49.14 
 
 		 116 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  41.44 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  41.44 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  41.44 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  45.79 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  40.35 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  43.7 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.57 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  51.43 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  46.23 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  41.74 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.62 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  46.23 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  40 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  52.83 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  44.44 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  44.44 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  40.35 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  37.84 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  49.09 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  46.96 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  47.71 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.44 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  36.84 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  43.86 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>