More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1012 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
125 aa  256  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  82.4 
 
 
125 aa  221  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  75.81 
 
 
125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  66.67 
 
 
126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  68.38 
 
 
120 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  61.02 
 
 
124 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  60.87 
 
 
123 aa  147  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  60.33 
 
 
127 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  60.5 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  64.71 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  63.87 
 
 
131 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  52.25 
 
 
116 aa  124  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  50 
 
 
122 aa  122  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  54.05 
 
 
117 aa  121  3e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
117 aa  118  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
121 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 
117 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 
118 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  44.35 
 
 
116 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
115 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  40.35 
 
 
116 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
114 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
118 aa  100  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
116 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  39.47 
 
 
116 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 
116 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
117 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  46.02 
 
 
119 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  42.98 
 
 
118 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
116 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  44.25 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  44.25 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  44.86 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  44.25 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  44.25 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  44.25 
 
 
119 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  41.59 
 
 
116 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  40.71 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  39.82 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  42.48 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  39.13 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  43.1 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
117 aa  95.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  43.64 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  35.96 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  40.71 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  40.71 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  40.71 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
113 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
113 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  38.6 
 
 
116 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  44.44 
 
 
367 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
114 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.51 
 
 
114 aa  94  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  49.52 
 
 
112 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
113 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  93.2  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  39.62 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.64 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  44.44 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  46.43 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  38.68 
 
 
114 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  45.28 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>