More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2566 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 125 aa  256  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  75.81 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  77.24 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  63.41 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  65.22 
 
 		 120 aa  160  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  56.52 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  56.78 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  52.17 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  54.95 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  50.86 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  57.27 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  51.26 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  50.42 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.69 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  42.2 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  46.73 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  41.28 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  47.57 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.82 
 
 		 367 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  44.55 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  49.52 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  39.66 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  38.26 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 114 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  38.05 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.45 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  42.99 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  36.52 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  35.65 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 118 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  36.52 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  37.17 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  41.59 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  45.87 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  40.19 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.79 
 
 		 115 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 117 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  44.55 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  43.64 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  36.28 
 
 		 116 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  43.64 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  40.57 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  37.17 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  37.17 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  37.17 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  43.64 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>