More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0679 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 123 aa  253  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  70.25 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  66.94 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  63.71 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  65.32 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  64.52 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  60.87 
 
 		 125 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  53.45 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  57.76 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  57.39 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  56.52 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  50.43 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  48.21 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  50.45 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  47.66 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  43.52 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  45.79 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  44.86 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.36 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  43.93 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.99 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  44.04 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  45.3 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  46.3 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  41.59 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  40.98 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  40.74 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  42.02 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  40.74 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  40.74 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  37.96 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  40 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  40.34 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  39.82 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.89 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  43.09 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  39.17 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  42.62 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  38.98 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  41.67 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  40.71 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  38.94 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>