More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1625 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
126 aa  254  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  66.67 
 
 
125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  63.41 
 
 
125 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  61.79 
 
 
125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  63.48 
 
 
120 aa  161  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  53.45 
 
 
123 aa  140  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  54.95 
 
 
116 aa  133  7.000000000000001e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  52.68 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  49.14 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  53.72 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  52.99 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  52.99 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  51.67 
 
 
127 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  52.89 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 
131 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  50.93 
 
 
118 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
118 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
114 aa  105  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
117 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 
116 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  45.79 
 
 
117 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  48.6 
 
 
119 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0977  HIT family protein  42.59 
 
 
121 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  42.59 
 
 
121 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  42.59 
 
 
121 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  43.52 
 
 
121 aa  99  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  42.86 
 
 
116 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  45.37 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  41.96 
 
 
116 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.9 
 
 
367 aa  95.9  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  41.07 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 
117 aa  94.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  39.13 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  41.96 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  43.52 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
118 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
118 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
118 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
118 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  44.95 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  37.5 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  43.93 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
114 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  39.29 
 
 
116 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
113 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
113 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  40.18 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  38.32 
 
 
114 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  39.29 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  48.54 
 
 
112 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  45.79 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  40.18 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  41.23 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  41.67 
 
 
113 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  38.39 
 
 
116 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  41.53 
 
 
144 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  37.38 
 
 
114 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>