More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1996 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  100 
 
 		 114 aa  235  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  97.37 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  59.65 
 
 		 114 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  62.5 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 		 114 aa  153  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 		 113 aa  150  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  59.82 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  55.75 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  58.93 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  62.5 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 		 114 aa  146  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 		 114 aa  141  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 114 aa  140  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  58.93 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  50.89 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  50.89 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  58.04 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  49.57 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  54.87 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  50.88 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 114 aa  131  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  55.05 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 114 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  48.25 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  48.25 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 		 116 aa  127  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  52.68 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  43.86 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.86 
 
 		 367 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.91 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  45.61 
 
 		 114 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  46.22 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 119 aa  121  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  43.86 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  42.48 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  47.32 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 115 aa  116  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 		 116 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  50.47 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  52.78 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>