More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0199 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0199  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2690  histidine triad (HIT) protein  92.91 
 
 		 127 aa  229  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450776  normal  0.2513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1029  histidine triad (HIT) protein  92.13 
 
 		 131 aa  228  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1679  histidine triad (HIT) protein  74.4 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1856  histidine triad (HIT) protein  72.5 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474639  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0679  histidine triad (HIT) protein  63.71 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.778303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  60.33 
 
 		 125 aa  146  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2381  histidine triad (HIT) protein  55.37 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.116169  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1625  histidine triad (HIT) protein  51.67 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_002978  WD1125  HIT family protein  42.5 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  42.61 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  42.61 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.61 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.02 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 117 aa  85.5  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  44.25 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  45.05 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  42.74 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  38.79 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  36.89 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  37.29 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  37.61 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  38.46 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0487  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  37.84 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  39.66 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  39.5 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  38.46 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  36.44 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  40.71 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  36.89 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  36.44 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  35.34 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  38.66 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  42.15 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  42.2 
 
 		 367 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  37.17 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  36.75 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>