More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0191 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
115 aa  238  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  76.52 
 
 
126 aa  191  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  63.96 
 
 
114 aa  157  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  54.78 
 
 
113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  54.78 
 
 
114 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 
114 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
135 aa  140  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  53.45 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  58.04 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  53.91 
 
 
113 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  54.95 
 
 
126 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0069  HIT (histidine triad) family protein  52.17 
 
 
113 aa  136  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00781  HIT (histidine triad) family protein  52.17 
 
 
113 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
113 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
114 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
114 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
113 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 
114 aa  135  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
114 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  50.45 
 
 
111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  50.45 
 
 
111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  57.27 
 
 
131 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
114 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  53.04 
 
 
115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  133  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  49.11 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00791  HIT (histidine triad) family protein  50.43 
 
 
113 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715274  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  51.3 
 
 
146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
114 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 
116 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  50.43 
 
 
113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  48.7 
 
 
113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
113 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  54.21 
 
 
116 aa  130  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 
114 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  52.78 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  49.12 
 
 
123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
118 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
114 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  50.93 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
122 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
116 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  53.21 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 
113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.96 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
115 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
128 aa  124  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  51.85 
 
 
116 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  49.07 
 
 
116 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
113 aa  123  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
112 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
112 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
113 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
112 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
113 aa  122  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  50.45 
 
 
116 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
112 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  45.95 
 
 
114 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  48.21 
 
 
112 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 
117 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 
117 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  50 
 
 
117 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16130  predicted protein  49.14 
 
 
137 aa  121  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.145557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 
126 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
114 aa  120  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
114 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  49.56 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  44.14 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  45.95 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  46.85 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  46.85 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 
114 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  46.9 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  47.32 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  46.85 
 
 
112 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
126 aa  114  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33695  predicted protein  45.22 
 
 
138 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  46.9 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  44.86 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.36 
 
 
367 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>