More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2845 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 126 aa  256  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  77.42 
 
 		 128 aa  199  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  74.36 
 
 		 121 aa  189  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  68.25 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  67.72 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  68.85 
 
 		 131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  69.42 
 
 		 126 aa  176  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  51.35 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  49.55 
 
 		 113 aa  127  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  49.55 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  48.18 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  53.7 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  47.86 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  52.25 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 116 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  47.37 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  54.64 
 
 		 113 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  52.58 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  52.58 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  43.64 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  45.05 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.02 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  46.36 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  46.36 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  45.05 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  46.3 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  49.07 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  48.15 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.3 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.24 
 
 		 367 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.25 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  43.24 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  49.55 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  48.15 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  48.15 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  48.15 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  46.85 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  49.55 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  47.22 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>