More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0455 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  229  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  96.97 
 
 		 113 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  92.93 
 
 		 113 aa  191  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  58.56 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  57.55 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  58.88 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  57.01 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  58.56 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  58.65 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  53.1 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  48.67 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  47.75 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  52.21 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  48.65 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  50.47 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  50.47 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  51.33 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  53.27 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  53.27 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  50.47 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  49.11 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  49.04 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 		 117 aa  119  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  50.47 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  49.53 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 112 aa  116  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  47.75 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  50.94 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  46.3 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  51.46 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  50.45 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  45.95 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  50.45 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  48.65 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  50 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  47.66 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  48.65 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.3 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  42.99 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  48.65 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>