More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1572 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  100 
 
 
116 aa  239  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  60.18 
 
 
113 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  60.18 
 
 
114 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  58.41 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  57.52 
 
 
114 aa  150  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  61.11 
 
 
114 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  55.75 
 
 
114 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  56.25 
 
 
113 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  54.87 
 
 
114 aa  147  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
114 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
114 aa  144  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 
114 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  57.01 
 
 
114 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  56.64 
 
 
113 aa  140  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  56.88 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  53.21 
 
 
114 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
114 aa  137  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
113 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 
113 aa  136  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
113 aa  135  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  53.04 
 
 
118 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  54.87 
 
 
114 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  50 
 
 
123 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 
112 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  51.79 
 
 
113 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  56.25 
 
 
112 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  56.03 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 
112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 
112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 
112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  50.86 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  52.25 
 
 
114 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  51.79 
 
 
113 aa  131  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  54.46 
 
 
112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
114 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
113 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  53.57 
 
 
112 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  51.75 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  51.79 
 
 
112 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  50.86 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
114 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
131 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 
116 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  47.32 
 
 
367 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 
135 aa  124  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 
128 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 
114 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
116 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 
118 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  49.56 
 
 
113 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
112 aa  123  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  51.75 
 
 
114 aa  123  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  49.56 
 
 
113 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  48.25 
 
 
121 aa  122  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
115 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 
122 aa  120  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 
112 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 
114 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
112 aa  120  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 
114 aa  120  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  45.69 
 
 
117 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  44.74 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.02 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  46.61 
 
 
119 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  58 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  49.07 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.98 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  48.15 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
112 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  49.07 
 
 
116 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>