More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0797 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  100 
 
 
112 aa  233  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  99.11 
 
 
112 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  82.14 
 
 
112 aa  196  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  75.89 
 
 
112 aa  182  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  75.89 
 
 
112 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  73.21 
 
 
126 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  75 
 
 
112 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  74.11 
 
 
112 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  74.11 
 
 
112 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  74.11 
 
 
112 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  61.95 
 
 
113 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  61.26 
 
 
113 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  60.71 
 
 
114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  59.82 
 
 
114 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  59.82 
 
 
114 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  60.71 
 
 
114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  53.1 
 
 
113 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  53.1 
 
 
113 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  55.36 
 
 
114 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  57.52 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  56.25 
 
 
115 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 
114 aa  134  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
113 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
113 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  56.76 
 
 
113 aa  133  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  56.76 
 
 
113 aa  133  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  52.25 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 
113 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
113 aa  131  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  54.46 
 
 
116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
114 aa  129  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
113 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
114 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
114 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
114 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  53.57 
 
 
114 aa  124  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 
114 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  53.92 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
119 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
121 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
122 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
112 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
132 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  53.7 
 
 
114 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
119 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
119 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
118 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  54.9 
 
 
116 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 
116 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  51.96 
 
 
115 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
118 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  48.65 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  54.37 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  51.96 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
126 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 
126 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  54.55 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  50.45 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 
118 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
118 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  53.92 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
115 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  52.53 
 
 
113 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
114 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 
119 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
113 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  54.9 
 
 
112 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
170 aa  114  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  46.43 
 
 
367 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 
112 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  53.92 
 
 
114 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  47.71 
 
 
113 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  51.79 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>