More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3376 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 116 aa  233  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  59.13 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  55.65 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  57.55 
 
 		 115 aa  129  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  54.72 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  55.56 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  51.96 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  51.96 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  49.57 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 118 aa  116  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 113 aa  116  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  51.89 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 		 114 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  47.83 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  50.94 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  46.36 
 
 		 113 aa  110  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  46.36 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  51.55 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.95 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  48.65 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  45.87 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  50.52 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  53.47 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.62 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.62 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  48.45 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 		 116 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  46.23 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  47.62 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  42.61 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>