More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3238 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 118 aa  248  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  83.9 
 
 		 118 aa  216  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  63.03 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  63.64 
 
 		 116 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  61.34 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  67.31 
 
 		 117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  60.53 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  57.98 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  61.4 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  63.11 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  55.77 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  59.26 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  54.24 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  54.24 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  50.42 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  50.42 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  49.58 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  48.74 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  44.95 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  50.46 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  47.22 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  50.46 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  47.22 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  47.22 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  44.04 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  50 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.18 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.47 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  48.15 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  45.45 
 
 		 367 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 112 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  45.87 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  50 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  49.06 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0907  HIT family protein  45.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.801892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  45.37 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  45.37 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  45.87 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  45.87 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  46.94 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0915  HIT family protein  45.38 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  45.71 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>