More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0115 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 118 aa  245  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  91.53 
 
 		 118 aa  226  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  68.38 
 
 		 120 aa  183  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  66.38 
 
 		 118 aa  167  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  64.66 
 
 		 132 aa  166  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  67.52 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  61.02 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  62.71 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  62.71 
 
 		 119 aa  163  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  62.71 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  61.86 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  58.82 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  57.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  60.87 
 
 		 123 aa  150  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  56.3 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  58.97 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  57.94 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  54.24 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  53.39 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  53.1 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 		 116 aa  123  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  56.07 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  54.72 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  54.72 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  52.83 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  49.53 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  49.53 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 113 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 113 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  52.34 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  52 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  50.5 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  49.5 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.61 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  52.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  52.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  52.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  44.86 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  42.99 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 113 aa  103  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  44.86 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  43.75 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 116 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 112 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.98 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  44.55 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  44.55 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>