More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1423 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
111 aa  228  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  61.47 
 
 
110 aa  154  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  50 
 
 
114 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  53.21 
 
 
114 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
112 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  48.62 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  47.71 
 
 
114 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 
113 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
114 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
114 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
114 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  46.73 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  46.73 
 
 
113 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
114 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
119 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
114 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
114 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  42.06 
 
 
367 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
114 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
114 aa  105  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
114 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
114 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
114 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  43.64 
 
 
116 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
121 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  44.34 
 
 
112 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
117 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
114 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
115 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
120 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
118 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
114 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
126 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
132 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
112 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
117 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
116 aa  100  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  43.64 
 
 
116 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
114 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 
115 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  40.57 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.4 
 
 
112 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
118 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
119 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 
115 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  40.37 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  40.57 
 
 
112 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  41.67 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  40.57 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
119 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  40 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  40.95 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  39.29 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  40.91 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  40.37 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  40.91 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  40.95 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  43.64 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>