More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0312 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 110 aa  220  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  61.47 
 
 		 111 aa  154  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  44.86 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 114 aa  105  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  43.52 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.35 
 
 		 367 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  42.59 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 114 aa  95.9  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  39.45 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  34.86 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.05 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  35.19 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  37.96 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  38.53 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  35.85 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  37.38 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 115 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  36.45 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  33.94 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  36.45 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  32.73 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  36.45 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  36.45 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  37.37 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  37.37 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.91 
 
 		 124 aa  87  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  40.37 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  41.9 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>