More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1423 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  100 
 
 		 114 aa  234  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  85.96 
 
 		 114 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  71.93 
 
 		 114 aa  183  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  70.18 
 
 		 114 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  68.42 
 
 		 126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  64.91 
 
 		 367 aa  167  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  63.16 
 
 		 114 aa  160  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  61.4 
 
 		 114 aa  157  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 		 114 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 114 aa  146  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  53.98 
 
 		 115 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 114 aa  137  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  52.25 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 114 aa  129  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  50 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  45.61 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  47.32 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  45.61 
 
 		 114 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  47.32 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  50.45 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  50.44 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  48.67 
 
 		 123 aa  120  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.95 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  50.45 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  50.45 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  47.75 
 
 		 116 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  45.61 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  45.61 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  47.27 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  47.37 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.22 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  46.85 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  50.94 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  46.15 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  44.95 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  44.95 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  46.43 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  44.25 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  45.87 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  47.96 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>