More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0865 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  100 
 
 		 120 aa  247  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  72.9 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  64.22 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.25 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  62.62 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  54.46 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  53.64 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.73 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  52.83 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  51.89 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  52.78 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3399  histidine triad (HIT) protein  60.19 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.53 
 
 		 115 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  48.15 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  48.15 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.17 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  49.04 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  45.28 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 114 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  43.86 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  44.83 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  44.34 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  46.96 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  45.71 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 116 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.3 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  42.99 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  42.99 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  41.07 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  39.25 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 114 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  47.52 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  42.31 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  43.81 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>