More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2189 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
119 aa  235  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  62.18 
 
 
119 aa  167  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  69.91 
 
 
118 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  65.14 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
116 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  51.75 
 
 
118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  57.39 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  56.19 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  58.72 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  50.93 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  54.81 
 
 
124 aa  123  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.21 
 
 
115 aa  120  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 
115 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.68 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  52.54 
 
 
119 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.29 
 
 
130 aa  114  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  46.55 
 
 
131 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  57.02 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 
114 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
118 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  45.13 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3399  histidine triad (HIT) protein  52.07 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204774  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
113 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
113 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  46.22 
 
 
128 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 
127 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 
114 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 
114 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
114 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
114 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
114 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.86 
 
 
116 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
126 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
113 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
114 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  39.29 
 
 
113 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 
114 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
115 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  39.29 
 
 
113 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 
114 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  40.37 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  42.34 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  37.17 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  41.44 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  37.17 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  39.09 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
119 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  44.04 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 
121 aa  95.9  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  45.87 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
114 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 
114 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  44.64 
 
 
112 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 
121 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  42.27 
 
 
113 aa  94  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  40.91 
 
 
112 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
114 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  43.24 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  38.33 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>