More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  100 
 
 		 118 aa  234  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  69.91 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1547  histidine triad (HIT) protein  63.39 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  52.25 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  57.39 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  55.86 
 
 		 124 aa  127  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.33 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  52.17 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  58.72 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  51.4 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  54.21 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  55.24 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  49.58 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.54 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  46.55 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.33 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3399  histidine triad (HIT) protein  61.32 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  46.79 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  50 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  46.79 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  46.39 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 114 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  46.39 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  41.28 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  41.28 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  44.33 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  42.59 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  42.59 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  39.81 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1195  HIT family hydrolase  43.52 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.578491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.93 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  43.81 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 111 aa  90.5  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  41.75 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  42.45 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  41.12 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  43.4 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  43.4 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>