More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2955 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2955  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 123 aa  256  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550959  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0702  histidine triad (HIT) protein  72.41 
 
 		 118 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  69.49 
 
 		 120 aa  182  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  71.93 
 
 		 119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  69.83 
 
 		 119 aa  180  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  64.71 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  71.93 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  69.83 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  68.97 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  60.87 
 
 		 118 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  58.26 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  55.93 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  56.9 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  49.17 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  50.43 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  51.28 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  48.72 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  48.72 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  49.57 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  48.72 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  48.72 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  50 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  50 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  49.09 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  46.73 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  49.06 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  45.79 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  41.74 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 113 aa  104  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.64 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.73 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  42.99 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  42.99 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 115 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  42.99 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  40.37 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  41.58 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  41.58 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  42.45 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  41.82 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  38.05 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  42 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.53 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  40.37 
 
 		 118 aa  94  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 116 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.12 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  39.25 
 
 		 367 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>