More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0643 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 114 aa  235  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  52.38 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.46 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.04 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.67 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  47.37 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  45.61 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  43.52 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0868  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 114 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  40.37 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  41.28 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  44.23 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.64 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  37.38 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  38.32 
 
 		 367 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  37.38 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  40.87 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  42.73 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  43.93 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0413  HIT domain-containing protein  40.19 
 
 		 117 aa  95.1  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  41.75 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  41.12 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  40.57 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  39.25 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.2 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  40.91 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3592  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0826  HIT family protein  38.46 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  38.53 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  38.53 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  43.52 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  36.28 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  43.48 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>