More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02440 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02440  HIT domain, putative  100 
 
 
116 aa  234  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  79.13 
 
 
119 aa  191  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  77.98 
 
 
117 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  77.98 
 
 
117 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  63.96 
 
 
121 aa  143  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  60.75 
 
 
114 aa  137  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
118 aa  135  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  57.66 
 
 
123 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  52.25 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  53.21 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
118 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  55.05 
 
 
117 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 
113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
117 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
117 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
117 aa  127  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  51.38 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 
114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  54.13 
 
 
116 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  52.29 
 
 
116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  50.46 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  52.29 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  51.38 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  51.38 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  52.29 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  53.21 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  52.38 
 
 
113 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
116 aa  123  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  53.21 
 
 
116 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  56.48 
 
 
115 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
118 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  57.27 
 
 
113 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0428  Hit family protein  48.62 
 
 
121 aa  122  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  50.46 
 
 
116 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  51.3 
 
 
114 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
115 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
114 aa  120  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  54.63 
 
 
112 aa  120  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1618  purine nucleoside phosphoramidase  54.95 
 
 
119 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104528  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  54.95 
 
 
114 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  56.73 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.675455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  55.05 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  54.21 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  49.55 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
125 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 
114 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
125 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
125 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  55.77 
 
 
112 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
125 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  55.77 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2276  HIT family protein  44.95 
 
 
116 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.264441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
126 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  54.13 
 
 
119 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 
113 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 
113 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  48.62 
 
 
116 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  57.41 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  48.65 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  54.81 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  53.77 
 
 
122 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  50.89 
 
 
115 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
114 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
126 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  49.52 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  49.53 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  50.46 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  48.6 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  49.53 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>