More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11288 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  100 
 
 
144 aa  289  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  75.86 
 
 
145 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  73.79 
 
 
145 aa  217  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  70.42 
 
 
143 aa  209  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  69.72 
 
 
143 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  69.72 
 
 
143 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  58.33 
 
 
140 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  41.91 
 
 
141 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  42.45 
 
 
139 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 
145 aa  100  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
144 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  40.88 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  35.34 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  40.19 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
135 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  42.99 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  42.99 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  41.3 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  41.6 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 
145 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  42.06 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  42.57 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  42.57 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  42.57 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  42.57 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 
143 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.62 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
136 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  35.88 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  41.58 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  39.26 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  41.58 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  41.58 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  38.61 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 
140 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  38.14 
 
 
141 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 
145 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.66 
 
 
140 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  38.66 
 
 
140 aa  87  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  42.57 
 
 
143 aa  87  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  37.38 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.32 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  41.82 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  33.87 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  39.45 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  39.45 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.27 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  41.58 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  37.61 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  34.26 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  39.64 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  39.81 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  40.54 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  39.05 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  38.33 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>