More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1664 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
145 aa  299  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  77.54 
 
 
139 aa  234  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  71.74 
 
 
141 aa  220  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  80.29 
 
 
137 aa  214  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  45.52 
 
 
151 aa  117  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 
143 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 
143 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  42.75 
 
 
145 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 
145 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
135 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 
145 aa  102  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
142 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
138 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  41.54 
 
 
144 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.06 
 
 
132 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
130 aa  100  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
139 aa  100  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  37.96 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
130 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  47.17 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  44.23 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  41.41 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  39.84 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
114 aa  95.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
139 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
148 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
140 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  37.96 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.05 
 
 
165 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.05 
 
 
144 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.05 
 
 
144 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  39.85 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.05 
 
 
144 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.05 
 
 
144 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.05 
 
 
144 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.05 
 
 
144 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  36.64 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  31.65 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 
149 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  37.8 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
143 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  41.8 
 
 
143 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  36.36 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  36.36 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.85 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.1 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  35.61 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  38.1 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  43.24 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.83 
 
 
144 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  36.92 
 
 
140 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
143 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  37.04 
 
 
131 aa  84  7e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  42 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  36.92 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  39.05 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  37.01 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  40.54 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  41.82 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  44.86 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  35.88 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  41 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  31.65 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1666  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225024  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  43.14 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1052  histidine triad (HIT) protein  39.2 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  33.86 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>