More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3726 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
138 aa  286  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  53.45 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  53.45 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  44.93 
 
 
140 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 
138 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  54.7 
 
 
141 aa  121  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
136 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  41.04 
 
 
142 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  43.38 
 
 
139 aa  121  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  49.57 
 
 
144 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  49.57 
 
 
165 aa  120  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  49.57 
 
 
144 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  49.57 
 
 
144 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  47.29 
 
 
132 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  49.57 
 
 
144 aa  120  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  42.65 
 
 
139 aa  120  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  49.57 
 
 
144 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  49.57 
 
 
144 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  48.72 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  48.72 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  42.03 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  47.86 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 
144 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
149 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.29 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  41.23 
 
 
143 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  41.23 
 
 
145 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 
139 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  39.55 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 
141 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  46.79 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
145 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 
137 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  42.54 
 
 
141 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  37.23 
 
 
139 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  34.53 
 
 
139 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
144 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  37.19 
 
 
143 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  40.32 
 
 
140 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
148 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  40.19 
 
 
140 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
145 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
140 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  40.19 
 
 
140 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
138 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 
143 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
142 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  45.38 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  46.6 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  39.34 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  43.52 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  38.32 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  37.98 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  37.68 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  41.38 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  39.47 
 
 
145 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 
139 aa  94  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
174 aa  93.6  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  36.36 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.59 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
141 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  42.2 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  35.25 
 
 
142 aa  92  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  41.28 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  41.28 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  41.28 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  41.59 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  41.28 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  41.28 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  41.28 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>