More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1009 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
139 aa  278  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  47.1 
 
 
151 aa  123  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  48.18 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
137 aa  104  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
138 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  35.46 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 
136 aa  98.2  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  35.97 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  39.55 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.42 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  32.37 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  34.78 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.62 
 
 
165 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 
114 aa  90.9  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  39.62 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  40 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  38.74 
 
 
139 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  39.45 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  41.58 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  41.32 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  40 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  32.26 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
149 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.65 
 
 
144 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
136 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  32.54 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  35.58 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  42.16 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.62 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  31.45 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  35.62 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  40.2 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  41.28 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  29.23 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  31.36 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  30.15 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  34.29 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  35.85 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  34.95 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  36.28 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  30.08 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  34.95 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
114 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  36.89 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  39.83 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0811  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  42.16 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.29 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  34.78 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  35.59 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>