More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1444 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  100 
 
 
144 aa  298  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  51.82 
 
 
144 aa  150  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  52.9 
 
 
140 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  48.92 
 
 
143 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  50.38 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.24 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  46.76 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  54.55 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  45.93 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  44.83 
 
 
165 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  44.83 
 
 
144 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  44.83 
 
 
144 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  44.83 
 
 
144 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  44.83 
 
 
144 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
144 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  44.14 
 
 
144 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  44.14 
 
 
144 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
144 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  44.14 
 
 
144 aa  120  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  44.14 
 
 
144 aa  120  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  44.29 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  41.73 
 
 
138 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
140 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
140 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  53.64 
 
 
141 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  45.05 
 
 
139 aa  103  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  39.01 
 
 
139 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
136 aa  101  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  35.21 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  44.76 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  42.34 
 
 
133 aa  94  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
140 aa  94  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  43.12 
 
 
135 aa  92  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
149 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  34.72 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
136 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  39.71 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
113 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  44.95 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  36.3 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
139 aa  87  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  43.14 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  39.09 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  41.44 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
148 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  39.62 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
135 aa  84  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 
126 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 
145 aa  84  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  43.14 
 
 
140 aa  84  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  31.65 
 
 
139 aa  84  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  43.14 
 
 
140 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 
130 aa  83.6  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 
145 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  38.18 
 
 
114 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  37.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  42.16 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  34.33 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.45 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  27.59 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  41.82 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  37.3 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  40.71 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  36.67 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>