More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0296 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  100 
 
 		 127 aa  264  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  49.22 
 
 		 1077 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  52.85 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  48.39 
 
 		 122 aa  123  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  49.19 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  47.97 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  50.39 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  47.54 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  49.18 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  39.52 
 
 		 284 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  46.6 
 
 		 1418 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  48.76 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  44.88 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  45.74 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 289 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  47.54 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  43.9 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  43.85 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  45.05 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  35.83 
 
 		 289 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.37 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  50.54 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.68 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.45 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  47.89 
 
 		 1348 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  39.82 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  35.71 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.39 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.39 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  37.5 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  34.82 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  36.84 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  40.4 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  36.08 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  34.23 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  38.95 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  35.05 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  34.51 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  40.24 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  38.95 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  33.64 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  38.05 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.32 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>