249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5156 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  83.24 
 
 		 192 aa  328  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  68.97 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6130  histidine triad (HIT) protein  72.67 
 
 		 187 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  67.24 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  60.89 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  68.79 
 
 		 181 aa  231  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  65.7 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  66.25 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  60.34 
 
 		 183 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  65.09 
 
 		 185 aa  221  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  62.43 
 
 		 182 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  60.48 
 
 		 189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  62.87 
 
 		 192 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  60.47 
 
 		 191 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  55 
 
 		 187 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  55.49 
 
 		 195 aa  207  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3441  histidine triad (HIT) protein  62.21 
 
 		 182 aa  207  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000440827  hitchhiker  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  59.06 
 
 		 190 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 244 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 244 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  54.95 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  55.06 
 
 		 182 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  62.05 
 
 		 182 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  55.49 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  53.67 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  49.45 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  60.84 
 
 		 182 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  51.08 
 
 		 195 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  54.04 
 
 		 174 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.29 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  54.49 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  55.56 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3065  histidine triad (HIT) protein  55.74 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  49.41 
 
 		 182 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.37 
 
 		 194 aa  174  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  45.34 
 
 		 171 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 		 169 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  51.3 
 
 		 170 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 171 aa  154  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  43.67 
 
 		 163 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  46.45 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  43.87 
 
 		 165 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  45.4 
 
 		 178 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  43.95 
 
 		 162 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 161 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 166 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  44.3 
 
 		 164 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  42.33 
 
 		 173 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  38.92 
 
 		 172 aa  141  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  48.23 
 
 		 163 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 		 172 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  48.23 
 
 		 163 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  44.03 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  43.48 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  44.94 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  46.54 
 
 		 169 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  45.27 
 
 		 163 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  44.3 
 
 		 160 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  48.23 
 
 		 163 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  47.77 
 
 		 163 aa  134  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  45.39 
 
 		 298 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  42.57 
 
 		 162 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  40.24 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  39.13 
 
 		 162 aa  132  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  36.59 
 
 		 173 aa  131  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  42.77 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  39.35 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  38.56 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  41.72 
 
 		 184 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  41.46 
 
 		 161 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  40.85 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0735  Hit family protein  40.14 
 
 		 172 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0925  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 152 aa  125  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.220033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  38.65 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  40.85 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 181 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  38.19 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  45.1 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  45.07 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  41.96 
 
 		 168 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  40.13 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  37.89 
 
 		 180 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  41.67 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  40.26 
 
 		 164 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 		 183 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  40.62 
 
 		 165 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  40.62 
 
 		 165 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  39.38 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  41.21 
 
 		 162 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  43.83 
 
 		 163 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 		 162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1617  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>